Centros de Custo

A FCiências.ID pode proceder ao pagamento de documentos “Proforma”?

Pode. Mas, os mesmos terão que ser substituídos por documentos definitivos, logo após o pagamento.
 

É possível fazer transferências de verbas entre diversos centros de custo da FCiências.ID?

Não.

É possível imputar o pagamento de um documento a diversos centros de custo?

Sim.